Microbioma y vías respiratorias superiores: la relación entre la composición bacteriana de la nasofaringe y la susceptibilidad a infecciones recurrentes (otitis, sinusitis, faringitis)

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Incluido en la revista Ocronos. Vol. VIII. Nº 7–Julio 2025. Pág. Inicial: Vol. VIII; nº 7: 1081

Autor principal (primer firmante): Andrés Daniel Contreras Suárez

Fecha recepción: 25 de julio, 2025

Fecha aceptación: 29 de julio, 2025

Ref.: Ocronos. 2025;8(7): 1081

https://doi.org/10.58842/IBSG4165

Autores:

Andrés Daniel Contreras Suárez. Médico Cirujano Universidad Regional Autónoma de Los Andes, Médico Rural Centro de Salud Tisaleo Tipo A, Tungurahua, Ecuador

Luis Fernando Aspiazu Ruiz. Médico Cirujano PUCE, Médico Independiente, Quito, Ecuador

Laura Valentina Cabra Rodríguez, Médico cirujano, Universidad Nacional de Colombia Libre Ejercicio de la Profesiòn. Bogotá

Laura Stefany Barrera Rivera, Médico Universidad Católica de Santiago de Guayaquil, Médico Consultorio Privado, Guayaquil Ecuador.

Resumen

El microbioma de las vías respiratorias superiores, particularmente el de la nasofaringe, desempeña un papel crucial en la homeostasis inmunológica y la protección contra patógenos. La alteración de esta comunidad microbiana, un estado conocido como disbiosis, se ha asociado con una mayor susceptibilidad a infecciones respiratorias recurrentes, como la otitis media, la sinusitis y la faringitis. Este artículo de revisión explora la evidencia científica actual que vincula la composición del microbioma nasofaríngeo con la predisposición a estas afecciones. Se discute cómo un microbioma estable y diverso, a menudo dominado por géneros comensales como Corynebacterium y Dolosigranulum, contribuye a la salud respiratoria mediante la exclusión competitiva de patógenos y la modulación de la respuesta inmune local. Por el contrario, la disminución de estas bacterias beneficiosas y el aumento de patobiontes potenciales, como Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae y Moraxella catarrhalis, se correlacionan con un mayor riesgo de episodios infecciosos recurrentes. El análisis de estas interacciones microbianas ofrece nuevas perspectivas para el desarrollo de estrategias preventivas y terapéuticas, como el uso de probióticos, para restaurar un microbioma saludable y reducir la carga de las infecciones respiratorias superiores recurrentes.

Palabras clave: Microbioma Nasofaríngeo, Vías Respiratorias Superiores, Infecciones Recurrentes, Otitis Media, Sinusitis, Faringitis, Disbiosis.

Introducción

Las infecciones de las vías respiratorias superiores (IVRS), que incluyen la otitis media (OM), la sinusitis y la faringitis, representan una de las principales causas de morbilidad a nivel mundial, especialmente en la población pediátrica (1). La recurrencia de estas infecciones no solo impacta la calidad de vida de los pacientes, sino que también conlleva un uso frecuente de antibióticos, lo que contribuye al creciente problema de la resistencia antimicrobiana (2). Durante décadas, el enfoque para entender estas enfermedades se centró en la identificación de patógenos específicos. Sin embargo, los avances en las técnicas de secuenciación de nueva generación han revelado que la nasofaringe alberga una comunidad microbiana compleja, cuyo equilibrio es fundamental para mantener la salud respiratoria (3).

La nasofaringe es la puerta de entrada principal para los patógenos respiratorios y, por lo tanto, la primera línea de defensa del huésped. El microbioma nasofaríngeo interactúa constantemente con el sistema inmunitario local, ayudando a su maduración y educándolo para discriminar entre microorganismos comensales y patógenos (4). Un estado de equilibrio, o eubiosis, en este nicho ecológico se caracteriza por una alta diversidad bacteriana y la predominancia de géneros que se consideran beneficiosos. La alteración de este equilibrio, denominada disbiosis, puede comprometer los mecanismos de defensa del huésped, facilitando la colonización y proliferación de bacterias patógenas y, en consecuencia, aumentando la susceptibilidad a las infecciones recurrentes (5).

Objetivos

Objetivo general

Analizar la evidencia científica disponible sobre la relación entre la composición del microbioma nasofaríngeo y la susceptibilidad a padecer infecciones respiratorias superiores recurrentes (otitis media, sinusitis y faringitis).

Objetivos específicos

1. Describir las características de un microbioma nasofaríngeo considerado saludable y los mecanismos mediante los cuales protege al huésped.
2. Identificar los patrones de disbiosis nasofaríngea asociados con un mayor riesgo de otitis media, sinusitis y faringitis recurrentes.
3. Evaluar el impacto de factores como el uso de antibióticos en la estabilidad del microbioma nasofaríngeo.
4. Discutir las implicaciones clínicas de estos hallazgos y las futuras direcciones en la prevención y tratamiento de las IVRS recurrentes.

Métodos

Se realizó una revisión narrativa de la literatura científica. La búsqueda bibliográfica se llevó a cabo en las bases de datos PubMed, Scopus y Google Scholar, abarcando artículos publicados principalmente entre 2019 y 2025. Se utilizaron términos de búsqueda como «nasopharyngeal microbiome», «upper respiratory tract infections», «recurrent otitis media», «chronic rhinosinusitis», «recurrent pharyngitis» y «dysbiosis». Se seleccionaron estudios observacionales, longitudinales, de casos y controles, y revisiones sistemáticas que analizaran la composición del microbioma nasofaríngeo mediante técnicas de secuenciación del gen 16S rRNA o metagenómica de escopeta en poblaciones humanas. Se priorizaron los estudios que establecían una correlación directa entre perfiles microbianos específicos y la frecuencia de las infecciones.

Resultados

La evidencia acumulada demuestra una clara asociación entre la composición del microbioma nasofaríngeo y la salud respiratoria.

El Microbioma Nasofaríngeo Saludable: Un estado de salud en las vías respiratorias superiores se asocia con un microbioma nasofaríngeo estable y diverso. En niños y adultos sanos, sin historial de infecciones recurrentes, se ha observado una mayor abundancia relativa de géneros como Corynebacterium y Dolosigranulum (6, 7). Se ha demostrado in vitro que estas bacterias pueden inhibir el crecimiento de patógenos respiratorios comunes. Por ejemplo, Dolosigranulum pigrum y Corynebacterium pseudodiphtheriticum han mostrado una capacidad significativa para reducir el crecimiento de S. pneumoniae, uno de los principales otopatógenos (7). Estos comensales beneficiosos contribuyen a la resistencia a la colonización, un mecanismo protector clave, al competir por nutrientes y sitios de adhesión en el epitelio nasofaríngeo y al producir compuestos antimicrobianos (8).

Disbiosis y Susceptibilidad a Infecciones Recurrentes: La recurrencia de las IVRS está consistentemente ligada a patrones de disbiosis en la nasofaringe.

• Otitis media recurrente (OMR): Los niños con OMR suelen presentar una menor abundancia de Corynebacterium y Dolosigranulum y un enriquecimiento de patobiontes como Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae no tipificable y Moraxella catarrhalis (9). Estos tres microorganismos, a menudo coexistiendo en biopelículas, son los principales agentes etiológicos de la otitis media aguda. Estudios longitudinales han observado que la inestabilidad del microbioma nasofaríngeo durante el primer año de vida precede al desarrollo de OMR (10). Además, en casos de OMR, se han identificado géneros como Alloiococcus y Turicella en el oído medio, sugiriendo una posible ruta de infección desde una nasofaringe disbiótica (11).
• Sinusitis recurrente/crónica: De manera similar a la OMR, los pacientes con rinosinusitis crónica (RSC) muestran una diversidad bacteriana reducida en su cavidad sinusal y nasal en comparación con individuos sanos. Se ha reportado un aumento en la abundancia de Staphylococcus aureus y una disminución de comensales protectores (12). La disbiosis en la RSC parece promover un estado inflamatorio crónico en la mucosa sinonasal, lo que perpetúa los síntomas y la susceptibilidad a exacerbaciones agudas (13).
• Faringitis recurrente: Aunque menos estudiada que la OM y la sinusitis, la evidencia emergente sugiere que la disbiosis orofaríngea y nasofaríngea también juega un papel en la faringitis recurrente. Un microbioma alterado puede facilitar la colonización persistente por patógenos como Streptococcus pyogenes (estreptococo del grupo A). Se ha observado que la disfunción del microbioma, con una reducción de la flora comensal, se asocia con un curso más severo de la enfermedad en pacientes con nasofaringitis crónica (14).

El uso de antibióticos es un factor determinante en la alteración del microbioma. Aunque necesarios para tratar infecciones bacterianas, los antibióticos de amplio espectro no discriminan entre patógenos y comensales, lo que lleva a una disbiosis que puede aumentar la vulnerabilidad a infecciones posteriores, creando un círculo vicioso de recurrencia y tratamiento (15).

Discusión

La comprensión del microbioma nasofaríngeo ha transformado el paradigma de las infecciones respiratorias recurrentes, pasando de un modelo centrado en un único patógeno a uno ecológico y comunitario. La disbiosis nasofaríngea emerge como un factor de riesgo fundamental para la otitis media, la sinusitis y la faringitis recurrentes. Un microbioma saludable, rico en comensales como Corynebacterium y Dolosigranulum, ejerce un efecto protector al ocupar nichos ecológicos y competir activamente contra la colonización por patógenos potenciales (7, 8). La pérdida de estos «guardianes» microbianos, a menudo exacerbada por el uso de antibióticos, deja al huésped en una posición vulnerable.

La colonización de la nasofaringe por S. pneumoniae, H. influenzae y M. catarrhalis es un prerrequisito para el desarrollo de otitis media (9, 10). La dinámica competitiva y cooperativa entre estas bacterias y el resto del microbioma determina el resultado clínico. Cuando el ecosistema está desequilibrado, estos patobiontes pueden proliferar y ascender por la trompa de Eustaquio hacia el oído medio, desencadenando una respuesta inflamatoria. Un mecanismo similar ocurre en la sinusitis, donde la alteración del microbioma sinonasal promueve la inflamación crónica y la susceptibilidad a infecciones agudas (12, 13).

Estos hallazgos tienen importantes implicaciones clínicas. En primer lugar, subrayan la importancia de un uso juicioso de los antibióticos para preservar la integridad del microbioma respiratorio (15). En segundo lugar, abren la puerta a nuevas estrategias terapéuticas. La modulación del microbioma nasofaríngeo a través de probióticos específicos, utilizando cepas de Corynebacterium o Dolosigranulum, se perfila como un enfoque prometedor para prevenir las IVRS recurrentes. Restaurar un perfil microbiano saludable podría aumentar la resistencia a la colonización por patógenos y disminuir la frecuencia de las infecciones (8). Futuras investigaciones deberán centrarse en ensayos clínicos bien diseñados para validar la eficacia y seguridad de estas terapias basadas en el microbioma, así como en identificar biomarcadores microbianos que puedan predecir el riesgo de desarrollar infecciones recurrentes.

Conclusiones

La composición del microbioma bacteriano de la nasofaringe es un factor determinante en la susceptibilidad a las infecciones respiratorias superiores recurrentes. Un microbioma estable y diverso, dominado por géneros comensales como Corynebacterium y Dolosigranulum, se asocia con un estado de salud y protección contra patógenos. Por el contrario, la disbiosis, caracterizada por una menor diversidad y el predominio de patobiontes como Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae y Moraxella catarrhalis, constituye un factor de riesgo significativo para el desarrollo de otitis media, sinusitis y faringitis recurrentes. La modulación del microbioma nasofaríngeo representa una vía terapéutica innovadora y prometedora para la prevención de estas patologías tan prevalentes.

Bibliografía

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15. Sun L, Zhang X, Zhang Y, Liu Q, Yang R. The role of antibiotics in the management of acute upper respiratory tract infections. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:709695.

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